Al 3-lea etaj este Cortexul care ne deosebeste de orice alta specie. El isi termina dezvoltarea abia in jurul varstei de 25 de ani. Tocmai de aceea vedem unii tineri care abia dupa aceasta varsta incep sa-si asume responsabilitati.
Are mai multe regiuni ce ne permit invatarea manuirii obiectelor, o biblioteca de memorii, este sediul gandirii abstracte in care se pare ca doar noi ne putem imagina o realitate ce nu exista. Din cauza lui putem naviga in trecut si viitor, putem rezolva probleme complexe.
Nu e in stare de gandire automata, el este rational elaborat. De aceea are nevoie de foarta multa glucoza sa functioneze, in stare de somn consuma un sfert din energia corpului. Pentru ca e mare consummator de energie si gandeste mai incet, cand e nevoie de raspuns in fata pericolelor este taiat de etajele 1 si 2 de la energie prin reducerea fluxului de sange. Echipa creier reptilian si mamifer pune reflex si automat in functie protocoalele de supravietuire si duc toata energia la muschi inima si plamani pentru a scapa de tigru. In acelasi timp inchide activitatea organelor care nu ajuta la protocolul “Lupta sau Fuga” si canalizeaza spre muschi chiar si sangele din piele
Cortexul are 2 emisfere care fiecare coordoneaza motor jumatatea opusa a corpului.